Poucos anos após a fundação da missão, a aldeia foi destruída pelos espanhóis e restaurada mais tarde pelos portugueses
Em 1759, a aldeia de Taracoatéua ou Taracuariba, foi elevada à categoria de Lugar, com a denominação de Fonte Boa.
Formação Administrativa
Freguesia criada com a denominação de Nossa Senhora de Guadalupe, pela Lei Provincial n.º 92, de 06-11-1858Pela Lei n.º 251, de 22-04-1873, a freguesia foi transferida para o lugar Barreiras de Fonte Boa.
Elevada á categoria de vila com a denominação de Fonte Boa pelo Decreto n.º 92, de 28-03-1891, desmembradas do município de Tefé.
Em divisão administrativa referente ao ano de 1933, a vila o município aparece constituído de 3 distritos: Fonte Boa, Rio Jutaí e Uará.
Nos quadros de apuração recenseamento geral de 1-IX-1920, a vila aparece constituída 5 distritos: Fonte Boa, Cururema, Foz do Jutaí, Paraíso e Uará.
Em divisão administrativa referente ao ano de 1933, a vila aparece constituído do distrito sede.
Assim permanecendo em divisões territoriais datadas de 31-XII-1936 e 31-XII-1937.
Elevado à condição de vila com a denominação de Fonte Boa, pelo Decreto-lei Estadual n.º 68, de 31-03-1938.
No quadro fixado para vigorar no período de 1939-1943, o município é constituído do distrito sede.
Assim permanecendo em divisão territorial datada de 1-VII-1955.
Pela Lei Estadual n.º 96, de 19-12-1955, o município de Fonte Boa perdeu parte de seu território para constituir o novo Jutaí.
Em divisão territorial datada de 1-VII-1960, o município é constituído do distrito sede.
Assim permanecendo em divisão territorial datada de 2009.
Fonte: IBGE