Antigos moradores contam que no ano de 1943, caçadores que por aqui passavam encontrarão pedras de cristal à flor da terra, destacando entre eles: Inácio de Souza Parente e Manoel Ribeiro de Souza. Com a descoberta do cristal, instalou-se o garimpo e no local próximo a este foi construída uma pista de pouso de aeronaves leves, onde hoje se localiza a Avenida Salgado Filho (principal Avenida da cidade), o local era todo ornamentado por frondosas árvores de Pequi (origem do nome do Município). Sob a sombra dos Pequizeiros, garimpeiros e compradores de cristal realizavam negócios com o precioso minério. Dizem os antigos, que os viajantes e negociadores em comitiva no trajeto do Rio Tocantins para o Rio Araguaia em tropas, fizeram deste local ponto importante de encontro e realizações de negócios.
Com o avanço e sucesso dos garimpos, fixou residência no local o Senhor Longuinho Vieira Junior, seus familiares e diversos trabalhadores que o acompanhavam para a exploração do cristal. Foi dado a uns dos principais garimpos o nome de quebra martelo, alem de vários outros que ainda nos dias de hoje exploram essa atividade.
Senhor Longo Vieira, como era conhecido foi considerado o fundador do Município de Pequizeiro, por ter fixado residência no local e conservado o nome primitivo. Ele trouxe o primeiro automóvel para a região, o primeiro motor de luz, a primeira máquina de beneficiar arroz, construiu a primeira escola da região, instalou o escritório de beneficiamento de cristal e abriu várias estradas na região.
Pequizeiro até então, era parte integrante do município de Araguacema, onde o Senhor Longuinho Vieira Junior foi Prefeito e através do seu genro, Ex-Deputado Estadual Antonio Balestra Filho, foi concedido autonomia política ao Distrito, através da Lei Estadual nº 4.595 de 1° de Janeiro de 1.963 e sua instalação ocorreu 1º de Janeiro de 1.964, ou seja, um ano depois.
Após uma década e devido ao desenvolvimento de Colméia, que era distrito de Pequizeiro, a pedido de Políticos e com a comprovação da evolução demográfica e econômica a sede do município de Pequizeiro foi transferida para Colméia, através da Lei n° 8.809 de 14 maio de 1.980. Pequizeiro volta através dessa Lei à condição de Distrito mantendo o mesmo nome.
Graças a Lei Estadual nº 10. 397 de 30 dezembro 1.987, o Distrito de Pequizeiro foi desmembrado de Colméia sendo elevado novamente a condição de Município autônomo, mantendo seu nome primitivo e sendo estalado novamente em 1º Junho de 1.989, depois das eleições de 17 de Abril 1.989.
Pequizeiro celebrar festa religiosa de 1° a 13 de junho em louvor ao seu padroeiro Santo Antônio.
Fonte: IBGE