Mipibu é uma palavra de origem Tupi que significa surgir subtamente. Nos idos de 1630, o aldeamento existente no território, de nome Mopebu, era o maior e mais populoso entre as seis aldeias da Capitania do Rio Grande do Norte. No relatório do bragantino Adriano Wedouche constava que "existiam na capitania cinco ou seis aldeias que reunidas podiam contar de 700 a 750 índios flecheiros e que a principal flecha era chamada de Mopebu".
Os primeiros habitantes da região foram índios Tupis, que se localizaram nas proximidades do rio Mipibu, que recebeu esse nome por surgir de repente na famosa Fonte da Bica e percorrer por quatro quilômetros, até desaguar no rio Trairi.
Em adiantado processo de organização e sinais de povoação, o aldeamento passou a ser coordenado pelos frades Capuchinhos, no final do século XVII, até o ano de 1762, quando foi iinstalada a vila de São José do Rio Grande do Norte. Nesse período, com a saída dos Capuchinhos a coordenação dos destinos da comunidade foi assumida pelos próprios nativos.
A criação do município foi através do alvará de 3 de maio de 1758, instalado em 22 de fevereiro de 1762, com procedimento de Vila de São José do Rio Grande, numa homenagem conjunta a São José e ao Príncipe D. José Francisco Xavier. Em 16 de outubro de 1845, a vila de São José do Rio Grande foi elevada a categoria de cidade, passando a se chamar cidade de Mipibu.
Passados dez anos a cidade recebeu o nome de São José de Mipibu, numa união entre a religiosidade e o famoso rio que emerge da terra de maneira surpreendente.
Gentílico: mipibuense
Formação Administrativa
Distrito criado com a denominação de São José, por alvará de 03-06-1788.
Elevado à categoria de vila município com a denominação de São José, por alvará de 03-051758 e carta régia de 14-09-1758. Instalado em 22-02-1762.
Elevado à condição de cidade e sede municipal com a denominação de São José de Mipibu, pela lei provincial nº 125, de 16-10-1845.
Em divisão administrativa referente ao ano de 1911, o município São José de Mipibu é constituído do distrito sede.
Assim permanecendo em divisões territoriais datadas de 31-XII-1936 e 31-XII-1937.
Pelo decreto estadual nº 603, de 31-10-1938, são criados os distritos de Boa Saúde e Monte Alegre e anexado ao município de São José de Mipibu.
No quadro fixado para vigorar no período de 1939-1943, o município é constituído de 3 distritos: São José de Mipibu, Boa Saúde e Monte Alegre.
Pelo decreto-lei estadual nº 268, de 30-12-1943, o distrito de Monte Alegre passou a denominar-se Quirambu.
No quadro fixado para vigorar no período de 1944-1948, o município é constituído de 3 distritos: São José de Mipibu, Boa Saúde e Quirambu ex-Monte Alegre.
Pela lei estadual nº 146, de 23-12-1948, o distrito de Quirambu. Voltou a denominar-se Monte Alegre.
Em divisão territorial datada de 1-VII-1950, o município é constituído de 3 distritos: São José de Mipibu, Boa Saúde e Monte Alegre ex-Quirambu.
Pela lei estadual nº 910, de 24-11-1953, é criado o distrito de Vera Cruz ex-povoado e anexado ao município de São José de Mipibu.
Pela lei estadual nº 929, de 25-11-1953, desmembra do município de São José de Mipibu o distrito de Monte Alegre. Elevado à categoria de município.
Pela lei estadual nº 996, de 11-12-1953, desmembra do município de São José de Mipibu o distrito de Boa Saúde. Elevado à categoria de município com a denominação de Januário Cicco.
Em divisão territorial datada de 1-VII-1960, o município é constituído do distrito de 2 distritos: São Jose de Mipibu e Vera Cruz.
Pela lei estadual nº 2850, de 26-03-1963, desmembra do município de São José de Mipibu o distrito de Vera Cruz. Elevado à categoria de municípío.
Assim permanecendo em divisão territorial datada de 2007.
Alteração toponímica municipal
São José para São José de Mipibu alterado, pela lei provincial nº 125, de 16-10-1845.
Fonte: IBGE